亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析

• 作者: 刘爱英 商海红 巩万奎 李俊文 王中娜 石玉真 葛群 陈婷婷 龚举武
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 亚洲棉(G.arboreum L.) 棉纤维 NAC转录因子 序列分析 结构分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 52-64
• 页数: 13页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 6364字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201601007

摘要

基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ ATAF /CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异.利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长cDNA,将其命名为GaNA C20、GaNA C09和GaNA C69,初步的生物信息学分析发现GaNAC20和GaNAC)9基因均含有3个外显子和2个内含子,GaNAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础.