莲品种DNA指纹图谱的构建

• 作者: 姜莉 薛建华 赵思晨 邴艳红 马克平 马晓林
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: DNA指纹 微卫星 Nelumbo 品种鉴定 分子身份证
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 植物多样性
• 页码范围: 3-11
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2015157

摘要

为了克服单纯依据形态特性鉴定品种的局限性,我们开展了莲品种DNA指纹图谱构建研究,旨在对其品种的快速准确鉴定及专利权保护等起一定作用.本研究以圆明园保存的72个莲品种为实验材料,用来自不同地点的1,409份野生莲(Nelumbo nucifera)和58份美洲黄莲(N.lutea)群体样本作遗传背景参照.从104对核微卫星引物(nSSR)中筛选出15对,从17对叶绿体微卫星(cpSSR)引物中筛选出2对,共17对引物作为72个莲品种DNA指纹鉴定的条码.15对nSSR引物共检测到94个等位基因(平均6.27个),其中11个属于美洲黄莲,65个属于野生莲,18个不能区分;多态信息含量(PIC)介于0.3899-0.8023之间(平均0.5748).2对cpSSR引物共检测到13个单倍型,其中9个属于野生莲,4个属于美洲黄莲.全部17对引物标记结果显示,共有19个品种含有美洲黄莲遗传组分,其中8个母系来源于美洲黄莲;有36个品种(涉及12对引物)具有至少1个特有基因型;最少8对引物组合可完全区分开68个品种.有2组共4个品种组内全部17对引物均不能区分.本研究通过核心引物组合法使68个莲品种获得特异性DNA指纹.推荐13对nSSR和2对cpSSR共15对引物作为莲品种鉴定的核心条码,并建议将形态特征与DNA指纹相结合作为莲品种的鉴定标准.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马克平	中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室	158	6538	46.0	76.0
2	薛建华	中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室	7	32	3.0	5.0
3	姜莉		1	3	1.0	1.0
4	马晓林		3	9	3.0	3.0
5	邴艳红	中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室	2	29	2.0	2.0
6	赵思晨		1	3	1.0	1.0