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摘要:
数据库搜索方法被广泛应用于蛋白质串联质谱的鉴定之中,该方法主要包括4部分:去同位素峰、选取有效峰、产生理论图谱、对理论图谱与实验图谱进行相似度打分.其中打分函数是数据库搜索方法的核心,在此基础上探究了一种基于泊松分布模型下的蛋白质串联质谱鉴定算法,并合理的融入了峰强度信息.为了验证该算法的有效性及可靠性,将该算法搜索结果与主流鉴定商业软件Mascot和Sequest在FDR为1%的条件下进行比较,基于泊松分布模型的蛋白质串联质谱鉴定算法具有更高的鉴定量和鲁棒性.
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文献信息
篇名 基于泊松分布模型的蛋白质串联质谱鉴定算法研究
来源期刊 云南民族大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 数据库搜索 蛋白质鉴定算法 串联质谱 泊松分布模型
年,卷(期) 2016,(2) 所属期刊栏目 信息与计算科学
研究方向 页码范围 179-184
页数 6页 分类号 Q81
字数 3631字 语种 中文
DOI 12.3969/j.issn.1672-8513.2016.02.016
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱思敏 云南民族大学数学与计算机科学学院 2 4 1.0 2.0
2 李华梅 云南民族大学数学与计算机科学学院 3 6 2.0 2.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
数据库搜索
蛋白质鉴定算法
串联质谱
泊松分布模型
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
云南民族大学学报(自然科学版)
双月刊
1672-8513
53-1192/N
大16开
中国昆明市一二·一大街134号
1992
chi
出版文献量(篇)
2286
总下载数(次)
5
总被引数(次)
8502
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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