绵羊Wnt10b基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 崔凯 张媛媛 杨祖 王建魁 邓学梅
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: Wnt10b 绵羊 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 11-15
• 页数: 5页
• 分类号: S826.2
• 字数: 2588字
• 语种: 中文

摘要

Wnt10b是Wnt家族中重要成员之一,绵羊Wnt10b基因尚属未知.本研究利用RT-PCR和RACE技术克隆了绵羊Wnt10b基因的全序列,并对该基因进行了比较全面的生物信息学分析.结果表明:绵羊Wnt10b基因序列全长2321 bp,包括1116 bp的编码区序列,编码391个氨基酸;其可变剪接体Wnt10b-AS由于CDS序列部分缺失编码166个氨基酸.同源性分析发现,绵羊Wnt10b基因核苷酸和氨基酸序列与其它哺乳动物同源性较高.氨基酸序列分析发现该蛋白为亲水性不稳定蛋白,相对分子量为43.0254 kDa.预测含有6个磷酸化位点,5个豆蔻酰化位点,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主.生物信息学分析表明Wnt10b及Wnt10-AS均为分泌型跨膜蛋白,主要存在细胞外基质中,通过与细胞膜上受体结合,调控下游靶基因的表达.Wnt10b-AS由于缺失多个翻译后修饰位点,可能通过与主转录本不同的作用机制发挥生物学功能.本研究为进一步探讨Wnt10b基因在绵羊毛囊生长发育中的功能和作用机制奠定了信息学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔凯	中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室	30	309	9.0	16.0
2	邓学梅	中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室	46	910	18.0	29.0
3	杨祖	中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室	2	2	1.0	1.0
4	王建魁	中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室	4	19	2.0	4.0
5	张媛媛	中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室	10	195	3.0	10.0