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碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较
碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较
作者:
孙伟
王曌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
质谱
碰撞诱导解离(CID)
高能碰撞解离(HCD)
蛋白质组学分析
摘要:
为了比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解模式在蛋白质组学分析方面的差异,分别应用这两种模式对牛血清白蛋白和细胞裂解物进行分析。通过比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,发现在牛血清白蛋白中,HCD 碎裂方法所得的谱图匹配率和多肽 Mascot 得分均较高,表明其质谱图质量较好。在复杂样品细胞裂解物分析中,CID 碎裂方法鉴定到的谱图数、多肽数和蛋白数目均较多,表明该模式的灵敏度较高;HCD 碎裂方法所得的谱图匹配率和 Mascot 得分均较高,表明其质谱图质量较好。因此,这两种模式均可用于大规模蛋白质组学分析,CID 模式可提供更高的灵敏度,而 HCD 模式则可获得更高质量的质谱谱图。
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文献信息
篇名
碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较
来源期刊
质谱学报
学科
化学
关键词
质谱
碰撞诱导解离(CID)
高能碰撞解离(HCD)
蛋白质组学分析
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
140-146
页数
7页
分类号
O657.63
字数
3978字
语种
中文
DOI
10.7538/zpxb.youxian.2016.0004
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
孙伟
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院
28
168
8.0
12.0
2
王曌
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院
3
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高能碰撞解离(HCD)
蛋白质组学分析
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研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
质谱学报
主办单位:
北京中科科仪技术发展有限责任公司
中国物理学会质谱分会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-2997
CN:
11-2979/TH
开本:
大16开
出版地:
北京275信箱65分箱中国原子能科学研究院
邮发代号:
82-349
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
1837
总下载数(次)
1
总被引数(次)
12922
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