赤散囊菌MAPKs超家族的鉴定及分析

• 作者: 刘作易 刘建魁 刘永翔 王玉臣 谭玉梅 陈丽
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 赤散囊菌 促分裂原活化蛋白激酶(MAPK) MAPK激酶(MAPKK) MAPK激酶激酶(MAPKKK)
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1117-1129
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.150164

摘要

本研究以赤散囊菌Eurotium rubrum全基因组序列为对象,利用HMMER软件构建隐马尔可夫模型(hidden markov models,HMM)结合BLAST的方法鉴定了促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)超家族.通过构建系统发育树对鉴定蛋白进行分析,并利用MEME软件进行了保守性基序的预测及活性位点注释.分析结果表明,赤散囊菌基因组包含了4个MAPK蛋白,分别属于Hog1-type、MpkC-type、Slt2-type和Fus3/Kss1-type类型;3个MAPK kinase(MAPKK)蛋白,分别属于MKK1-type、Pbs2-type和Ste7-type类型;3个MAPK kinase kinase (MAPKKK)蛋白,分别属于BCK1-type、Ste11-type和Ssk22-type类型.保守性基序分析及注释结果表明,MAPKs超家族蛋白都包含了蛋白激酶活性位点“-D[L/I/V]K-”以及保守性的ATP-binding标签序列.MAPK与MAPKK蛋白分别包含了“-TxY-”和“-SD[I/V]WS-”磷酸化位点,且MAPK蛋白还包含一个保守性的common docking基序(CD motif),而MAPKKK蛋白则包含了一个功能不明的保守性基序,其一致性序列为“-GTPYWMAPEV-”.研究结果为揭示MAPKs信号途径在赤散囊菌中参与调控的生物学过程奠定了基础.