一株与儿童腹泻相关的跨多种属的基因重配G3P[3]型轮状病毒

• 作者: 农艺 张又 李荣成 莫兆军 董慧瑾 钱渊
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人轮状病毒 G3P[3] 基因组 基因重配
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 129-140
• 页数: 12页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

G3P[3]型别多见于猫/狗A组轮状病毒(Group A rotavirus,RVA).本研究前期工作中从广西农村一名腹泻儿童粪便标本中检测到1例在人的感染中少见的G3P[3]型RVA(命名M2-102),但经初步基因分析提示其VP7和VP4基因均同猫/狗G3P[3] RVAs进化距离远.为了解M2-102的种属来源,本研究对其全基因组11条基因进行了RT-PCR扩增、测序和序列分析.使用RotaC分型工具对所获得的M2-102全基因组基因序列进行分型.结果显示RVA/Human-wt/CHN/M2-102/2014/G3P[3]具有G3-P[3]-I3-R3-C3-M3-A9-N3-T3-E3-H6基因组型.序列分析进一步显示M2-102基因组中有5条基因(VP7、VP1、VP2、NSP2和NSP3)同云南蝙蝠MYAS33株亲缘关系近,处于相同的进化树支;另有5条基因(VP4、VP3、NSP1、NSP4和NSP5)同猿猴RRV株进化距离近,位于相同的进化树支;仅有1条基因VP6同人AU-1样RVAs处在相同进化树支,并具有较高核苷酸同源性.推测M2-102是一例由人AU-1样病毒同蝙蝠株MYAS33及猿猴株RRV类似病毒经基因重配而产生的多种属来源的重配毒株.