猪氨肽酶N(APN)基因密码子偏好性分析

• 作者: 刘颖 包文斌 吴圣龙 吴正常 宗秋芳 戴开宇
• 来源期刊: 扬州大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 APN基因 密码子偏好性
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 页码范围: 45-50,73
• 页数: 7页
• 分类号: S828.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2016.02.010

摘要

为了解猪氨肽酶N (APN)基因的密码子使用特性,运用EMBOSS软件包分析猪APN基因的密码子偏好性,并与模式生物基因组及其他13个物种APN基因进行比较,为选择合适的受体动物及最佳外源表达系统提供指导和依据.结果表明:猪APN基因大部分偏好使用以G/C结尾的密码子,存在23种偏好密码子(RSCU＞1),不同物种APN基因密码子偏好性比较发现14个物种的APN基因表达水平一般;基于RSCU和CDS的聚类分析发现,CDS的系统进化树更接近这14个物种的真实系统分类;在密码子的使用频率上,猪APN基因与小鼠基因组的差异小于大肠埃希菌和酵母菌等2种模式生物基因组.这一研究为APN基因在动物遗传改良中选择合适的受体动物、选择最佳的外源表达系统及提高其表达水平提供一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	包文斌		132	942	16.0	25.0
2	吴圣龙		95	641	14.0	20.0
3	刘颖		21	75	6.0	8.0
4	吴正常		12	45	4.0	6.0
5	宗秋芳		8	9	2.0	3.0
6	戴开宇		4	8	2.0	2.0