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利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性
利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性
作者:
吴洋
张路培
张静静
朱波
陈燕
高会江
高雪
齐欣
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
西门塔尔牛
亲缘关系系数
SNP
最小等位基因频率
摘要:
本研究旨在利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数,以期准确确定估计个体间亲缘关系系数所需的SNPs数量.研究以1 059头出生于2008-2012年的西门塔尔牛为试验群体,利用Illumina bovineHD(770 k)芯片,根据最小等位基因频率(MAF)区间,分别选择100、500、1 000、1 500、2 000、2 500和3 000个SNPs用于个体间亲缘关系系数的估计.结果显示,随着标记数目的增多,估计的亲缘关系系数准确性逐渐增加.且当SNP标记数目达到2 500时,所估计的亲缘关系系数与利用所有标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著,二者相关系数达到0.89以上.同时,利用不同等位基因频率区间内标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著.由此可以看出,当所选标记数目达到2 500以上时,可以得到较高的亲缘关系系数估计准确性.本研究为基于SNP标记信息估计亲缘关系系数的进一步研究提供了理论基础,同时为西门塔尔牛群体个体间亲缘关系的研究提供依据.
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篇名
利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
西门塔尔牛
亲缘关系系数
SNP
最小等位基因频率
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
遗传繁育
研究方向
页码范围
268-275
页数
8页
分类号
S823|S813.3
字数
5470字
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2016.02.008
五维指标
传播情况
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引文网络
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主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
相关基金
北京市自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Beijing Province
官方网址:
http://210.76.125.39/zrjjh/zrjj/
项目类型:
重大项目
学科类型:
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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畜牧兽医学报2016年第9期
畜牧兽医学报2016年第8期
畜牧兽医学报2016年第7期
畜牧兽医学报2016年第6期
畜牧兽医学报2016年第5期
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