miRNA-34基因家族进化分析及其在鹅生殖周期内的表达变化

• 作者: 云皓琪 刘然 张惠子 张扬 徐琪 陈国宏 陈阳 黄正洋
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅 miRNA-34 进化 定量表达
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 260-267
• 页数: 8页
• 分类号: S835.2
• 字数: 4758字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.02.007

摘要

旨在探明miRNA-34基因家族(miRNA-34s)系统进化历程及其在鹅生殖周期内的表达变化规律.通过文献和miRBase数据库检索脊椎动物的miRNA-34s序列,利用Ensembl数据库信息,确定miRNA-34s在基因组中的位置,采用MEGA 6.0构建miRNA-34s的系统进化树;并利用RT-qPCR检测鹅卵巢组织miRNA-34s在生殖周期内的表达变化.结果在脊椎动物中共搜索70余条miRNA-34s序列,miRNA-34s 3个成员(miRNA-34a、miRNA-34b和miRNA-34c)在脊椎动物中分布广泛,高度保守,均位于基因间隔区(Intergenic region,IGR),且miRNA-34b和miRNA-34c两个基因位于同一染色体上,在进化过程中紧密相连,可能是由于串联重复所致.RTqPCR检测结果显示,miRNA-34s 3个成员在鹅的开产前期、排卵期、排卵后期和就巢期卵巢组织中表现出相同趋势的表达,即在排卵期、排卵后期表达水平高于或显著高于开产前期和就巢期.miRNA-34家族在进化中高度保守,且在调控鹅生殖周期中发挥一定的作用.