肝细胞癌相关长链非编码RNA差异表达的研究

• 作者: 厉新妍 方亮 黄淑琳
• 来源期刊: 解剖学研究
• 关键词: 肝细胞癌 长链非编码RNA 长链非编码RNA芯片
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 272-277,281
• 页数: 7页
• 语种: 中文

摘要

目的 分析肝细胞癌与正常肝组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),发现可能与肝细胞癌发生发展相关的特异lncRNA.方法 采用lncRNA表达谱芯片技术检测5例肝细胞癌和其配对癌旁正常组织中的lncRNA,筛选出差异表达的lncRNA.运用分层聚类分析,对所有的lncRNA进行分类.最后从中选择10个lncRNA用RT-PCR进行定量验证.结果 有1359个lncRNA表达水平出现显著性差异,差异倍数＞2倍.其中629个显著上调,占46.2％,其中125个表达5倍以上;730个显著下调,占53.7％,其中110个表达5倍以上.聚类分析①基因间lncRNA有11706条,其中与已知编码基因相距＜300kb的lncRNA共有352条.②增强子型lncRNA共有1802条,其中与已知编码基因相距＜300kb的lncRNA共有42条.③HOX基因簇共有101条.RT-PCR结果有8条lncRNA表达趋势与基因芯片结果一致.对癌组和癌旁组进行检验,有6条差异有统计学意义(P＜0.05).结论 与癌旁组织比较,lncRNA肝细胞癌组织中的表达水平明显改变,可能与肝细胞癌的发生发展有关.