西藏部分地区12株藏族人群C/D重组型乙型肝炎病毒全基因序列分析

• 作者: 刘铁柱 尹文娇 张国民 张爽 沈立萍 王富珍 王锋 郑徽 顿珠多吉
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 藏族人群 乙肝病毒 全基因序列 重组分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 156-160
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

为了解藏族人群中流行的乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基因重组状况,收集藏族人群HBsAg阳性样本,提取HBV DNA并用巢氏PCR的方法扩增HBV全长序列,测序后用DNAstar软件拼接全基因序列,进一步利用MEGA6和Simplot软件进行序列同源性和系统进化分析.应用该方法获得12株藏族人群HBV全基因序列,分析结果显示12株样本为C/D重组型,其中9株样本的重组位点位于nt750,3株样本的重组位点位于nt 1526,以此可分为两种重组方式,分别命名为C/Da和C/Db;从总体序列同源性来分析12株样本均属于C基因型,且与现有的C1-C15亚型的核苷酸差异均大于4％,与C1亚型最为接近.从地理分布来看,C/Da来自西藏中部和北部的拉萨市、阿里和林芝地区,C/Db均来自西藏南部的山南地区,提示两种重组型C/Da和C/Db在西藏地区的地理分布具有一定规律.研究结果可为西藏地区特殊HBV基因重组、基因特征分析、病毒进化研究以及当地乙肝防控提供参考.