粗皮桉种源遗传多样性SSR分析

• 作者: 兰俊 李昌荣 梁建新 熊涛 蓝必布 邓紫宇 陈东林 陈升侃
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 粗皮桉 SSR标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 7-12
• 页数: 6页
• 分类号: S792.39
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.7

摘要

[目的]分析粗皮桉的亲缘关系及遗传多样性,为其种质资源利用及分子育种提供参考.[方法]以粗皮桉7个种源(种源1～7)75株样品为材料,基于覆盖巨桉全基因组的21个SSR标记,利用SSR位点、种源遗传分化及种源间遗传距离等分析粗皮桉群体遗传多样性.[结果]21对引物共扩增出252个等位基因(平均每个SSR引物扩增出12个),平均有效等位基因数(Ne)为4.5788,平均期望杂合度(HE)为0.7227,平均基因多样性(H)为0.7179,平均Shannon信息指数(I)为1.7150.7个种源的遗传多样性参数存在差异,其中种源3的遗传多样性参数最高.群体间的基因分化系数(FST)为0.0965,即9.65％的遗传变异存在于种源间,90.35％存在种源内.7个种源的遗传距离变化范围为0.0965～0.3188,平均为0.2061,聚类分析结果表明,当阀值为0.82时,7个种源被分为昆士兰北部种源和巴布亚新几内亚种源两大类;当阀值为0.84时,昆士兰北部的4个种源被进一步分为两大亚类,种源间遗传距离与种源的地理分布密切相关.[结论]粗皮桉7个种源存在较丰富的遗传多样性,适于开展长周期、多世代改良工作.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈升侃	广西大学林学院	2	10	2.0	2.0
2	蓝必布		2	10	2.0	2.0
3	梁建新		1	7	1.0	1.0