哈氏仿对虾线粒体16S rRNA和CO Ⅰ基因的序列比较及其与仿对虾属之间的系统进化分析

• 作者: 刘萍 李健 段亚飞 毛智超 陈萍
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 哈氏仿对虾 16S rRNA基因 CO Ⅰ基因 序列分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 页码范围: 1006-1017
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20150609910

摘要

为调查研究哈氏仿对虾浙江象山群体的种质资源、物种间的亲缘关系及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得哈氏仿对虾线粒体DNA的16S rRNA和CO Ⅰ基因片段,分别对其进行序列比较和系统进化分析.16S rRNA基因片段的T、C、A和G的含量分别是35.76％、19.48％、26.74％和17.88％;CO Ⅰ基因片段的T、C、A和G的含量分别是35.36％、12.68％、30.54％和21.43％;A+T含量显著高于G+C含量.16S rRNA基因片段长度为558 bp,共检测出1种单倍型,没有多态性位点;CO Ⅰ基因片段长度为688 bp,共检测出7种单倍型,6个多态性位点.CO Ⅰ基因片段比16S rRNA基因片段变异丰富,更适于哈氏仿对虾种群的遗传多样性分析.基于16S rRNA和CO Ⅰ基因片段的系统进化分析结果不太一致,结合形态学分析表明,哈氏仿对虾是仿对虾属独立的分支,与细巧仿对虾和亨氏仿对虾种类亲缘关系较近.根据CO Ⅰ基因片段的遗传距离推测出仿对虾属的大致分化时间发生在中新世末期至上新世早期.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室	215	3950	34.0	49.0
3	段亚飞	中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源开发利用重点实验室	12	107	6.0	10.0
4	毛智超	上海海洋大学水产与生命学院	1	3	1.0	1.0