利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性

• 作者: 唐君 李宗芸 王茹媛 石璇 罗永海
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘薯 SLAF-seq 分子标记 SNP 进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 641-647
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00641

摘要

选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体Ⅰ.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体Ⅰ.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体Ⅰ.temussima(2x)和Ⅰ.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35310个.通过序列分析,获得40765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树.结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种Ⅰ.trifida的亲缘关系比较近.这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宗芸	江苏师范大学生命科学学院	22	43	4.0	6.0
2	石璇	江苏师范大学生命科学学院	1	18	1.0	1.0
3	王茹媛	江苏师范大学生命科学学院	1	18	1.0	1.0
4	罗永海	江苏师范大学生命科学学院	1	18	1.0	1.0