蛋白质空间结构相似度多参数算法模型的建立

• 作者: 尹咪咪 张建华 张萍萍
• 来源期刊: 郑州大学学报（理学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质 相似度 回归分析 逐步回归 BP神经网络
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 页码范围: 105-109
• 页数: 5页
• 分类号: Q816
• 字数: 3199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13705/j.issn.1671-6841.2015211

摘要

通过收集165对蛋白质的结构文件,利用BLASTP比较它们的相似度.建立球极坐标系,分别将球体半径、方位角和仰角二等分和三等分,将蛋白质划分为8块和27块类似球壳碎片的区域.在此基础上,利用MATLAB计算12个参数相似度,用SPSS建立了二等分和三等分时总相似度和12个参数相似度的全回归模型、逐步回归模型和相关性回归模型.利用MATLAB建立BP神经网络模型,并与线性回归模型进行了对比.根据二等分时逐步回归模型的结果可以看出,原子个数相似度,C、N原子个数相似度,P、S的位置相似度以及密度相似度和总体相似度的相关性最显著.二等分时结果较三等分时好,逐步回归模型的结果最好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建华	郑州大学电气工程学院	87	604	15.0	20.0
2	张萍萍	郑州大学电气工程学院	4	31	3.0	4.0
3	尹咪咪	郑州大学电气工程学院	4	14	2.0	3.0