鸡Sepp1基因及其蛋白理化性质和分子结构的生物信息学分析

• 作者: 庞瑞华 李永能 李琦华 杨明华 潘洪彬 王顺利 赵素梅 黄英
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: Sepp1 鸡 生物信息学 理化性质 分子结构
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 84-94
• 页数: 11页
• 分类号: Q343.3+1
• 字数: 5429字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2016.02.04

摘要

硒是人和动物生命必需的微量元素,硒的生物学功能是通过硒蛋白来实现的,硒蛋白P(Selenoprotein P,Sepp1)是机体含量最多的硒蛋白.利用生物信息学相关分析软件和比较基因组学的方法,对鸡Sepp1基因序列和氨基酸序列进行理化性质和结构特征进行分析和预测,并与猪、人、鼠、羊、狗等物种进行比较.结果显示,鸡Sepp1的CDS序列和编码的蛋白质与禽类动物相似,但和哺乳类动物之间差别较大;Sepp1的功能特性与硒半胱氨酸含量有关,不同物种Sepp1中硒半胱氨酸含量存在着差异;鸡Sepp1蛋白在第170-200位氨基酸残基区域具有特定理化性质和分子结构,推测该序列可作为调控鸡Sepp1功能的靶位点.研究结果为以后深入研究鸡Sepp1的机体功能、开发富集Se的动物功能性食品提供理论参考.