粉尘螨过敏原 Der f21的生物信息学分析

• 作者: 刘志刚 刘晓宇 巴金戈 杨平常 林建立
• 来源期刊: 南昌大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 粉尘螨 Der f21 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 【基础医学】
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: R392.8
• 字数: 3365字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13764/j.cnki.ncdm.2016.03.001

摘要

目的：运用生物信息学方法对粉尘螨过敏原 Der f21特征进行分析。方法采用 clustalw2进行同源性分析、MEGA5工具包构建系统进化树、ProtParam Tools 预测其理化性质、KinasePhos 软件预测磷酸化位点。采用PSIPRED 预测其二级结构、SWISS-MODEL 预测其三级结构。用 DNAStar 对 Der f21的 B 细胞抗原表位进行预测。利用网络服务器 IEDB 内相关软件、Preprod、SYFPEITHI、NetMHCII 2．2 Server 和 NetMHCII pan 3．0 Sever对 Der f21蛋白 T 细胞抗原表位进行预测。结果粉尘螨基因组测序发现本实验室克隆的 Der f21基因与 Gen-Bank 上公布的屋尘螨 Der p21（GenBank：ABC73706．1）同源性为71％。系统进化树结果显示：粉尘螨与屋尘螨、棉兰皱皮螨、害嗜鳞螨亲缘关系比较近。磷酸化位点预测显示：Der f21含有1个丝氨酸激酶、1个苏氨酸激酶及1个酪氨酸激酶。二级结构及三级结构预测结果显示 Der f21的结构主要以α螺旋为主。B 细胞抗原表位预测得到5个肽序列（23～28、39～46、55～71、91～99、127～133）。T 细胞抗原表位预测得到4个肽序列（8～17、72～80、83～91和118～126）。结论对粉尘螨过敏原 Der f21的分子特征进行预测，为进一步研究尘螨过敏原的结构成分及其理化性质奠定理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘志刚	深圳大学医学院过敏反应和免疫学研究所	324	1724	17.0	23.0
2	刘晓宇	深圳大学医学院过敏反应和免疫学研究所	42	160	7.0	11.0
3	杨平常	深圳大学医学院过敏反应和免疫学研究所	28	67	5.0	6.0
4	林建立	深圳大学医学院过敏反应和免疫学研究所	4	3	1.0	1.0
5	巴金戈	深圳大学医学院过敏反应和免疫学研究所	2	0	0.0	0.0