极端嗜盐古菌Natrinema sp.J7-2的转录组学研究

• 作者: 张顺喜 梅运军 沈萍 胡纯 邓威
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: RNA-seq 转录组学 盐适应 嗜盐古菌
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 463-468
• 页数: 6页
• 分类号: Q93-31|Q935
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2016.05.0079

摘要

[目的]从转录组的角度研究极端嗜盐古菌Natrinema sp.J7-2的盐适应性.[方法]利用Illumina HiSeq 2000双末端测序技术对生长在不同盐浓度下(15％ NaCl、25％ NaCl、30％ NaCl)的Natnnemasp.J7-2的转录组测序分析,并对差异表达基因进行了GO与KEGG富集.[结果]转录组测序结果表明,培养在3种不同盐浓度下的Natrinema sp.J7-2差异表达基因主要富集到氨基酸代谢、卟啉与叶绿素代谢两条途径上,氨基酸代谢主要涉及谷氨酸、天冬氨酸、丙氨酸代谢;在3组盐培养物中,有1 320个基因存在差异,其中83个共同差异表达的基因.[结论]通过转录组分析揭示Natrinema sp.J7-2菌株主要通过调控氨基酸代谢与能量代谢来适应不同盐环境.