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摘要:
利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)标记结合二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术,研究广叶绣球菌(Sparassis latifolia)原基期、幼菇期和成熟子实体阶段的差异表达蛋白质组.采用Q-Exactive质谱鉴定并经ProteinPilot软件搜库,对所获得的差异蛋白进行GO (gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)和转录因子注释分析.结果共鉴定到可信蛋白2305个,其中2219个蛋白具有相对定量信息.与原基期相比,幼菇期显著上调蛋白104个,下调蛋白142个,子实体阶段显著上调蛋白155个,下调蛋白460个.GO分子功能提示这些差异性蛋白主要参与催化活性、蛋白结合和水解酶活性.KEGG代谢通路分析结果显示,差异蛋白主要涉及碳代谢、氨基酸合成、核糖体、糖酵解/糖衍生等代谢过程.差异蛋白中与信号传导和转录因子相关的蛋白数量分别为27个和7个.
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文献信息
篇名 广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析
来源期刊 食用菌学报 学科
关键词 广叶绣球菌 蛋白质组 iTRAQ 二维液相色谱串联质谱
年,卷(期) 2016,(3) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 1-9,封3
页数 10页 分类号
字数 5057字 语种 中文
DOI 10.16488/j.cnki.1005-9873.2016.03.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 应正河 福建省农业科学院食用菌研究所 31 236 10.0 14.0
2 林衍铨 福建省农业科学院食用菌研究所 68 321 10.0 14.0
3 马璐 福建省农业科学院食用菌研究所 25 101 5.0 9.0
4 江晓凌 福建省农业科学院食用菌研究所 23 113 7.0 10.0
5 肖冬来 福建省农业科学院食用菌研究所 20 54 3.0 6.0
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研究主题发展历程
节点文献
广叶绣球菌
蛋白质组
iTRAQ
二维液相色谱串联质谱
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
食用菌学报
季刊
1005-9873
31-1683/S
16开
上海市金齐路1000号
1994
chi
出版文献量(篇)
1367
总下载数(次)
5
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