中国广西龙虎山野生猕猴粪便的病毒宏基因组学分析

• 作者: 刘文彬 张翠媛 敖元云 李利利 段招军 虞结梅
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 病毒宏基因组学 猕猴 病毒组 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 273-282
• 页数: 10页
• 分类号: R3739|S852.65
• 语种: 中文

摘要

非人灵长类携带的病毒种类繁多,其中部分对人具有致病性.为深入了解我国野生猕猴携带病毒的状况,本研究应用MiSeq高通量测序及生物信息学分析技术,对从广西采集的280份猕猴粪便标本进行了病毒宏基因组学的分析.高通量测序共获得了233 726 79条读长(Reads),其中4641条序列与病毒相关,进一步注释到27个病毒科(包含细小病毒科中的细小病毒亚科和浓核病毒亚科),包括其中5种脊椎动物病毒(占78.2％)、6种昆虫病毒(占5.5％)、11种植物病毒(占10.4％)、其他的病毒(占9.8％);遗传进化分析结果显示,被注释为萨佩罗病毒、肠道病毒、细小病毒、腺相关病毒等序列与已知病毒相似,部分序列呈现明显的差异;应用PCR扩增进一步证实了病毒序列的真实存在.本研究初步确定了广西地区猕猴粪便中病毒的病毒谱,为深入分析和研究其中有潜在公共卫生意义的病毒奠定了基础.