四川地区鸡异刺线虫核糖体转录间隔区(ITS1/2)序列的遗传变异分析

• 作者: 古小彬 朱俊扬 杨光友 汪涛 王保健 赖为民 郑晶
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡异刺线虫 四川 ITS1/2序列 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 796-804
• 页数: 9页
• 分类号: S852.731
• 字数: 6379字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.04.020

摘要

探讨四川地区鸡异刺线虫(Heterakis gallinarum)的遗传变异情况,为该地区鸡异刺线虫病的流行特征及防控提供基础资料.采用PCR扩增四川7个地区共59个鸡源鸡异刺线虫核糖体ITS1-5.8S-ITS2片段并测序,所得序列剪切5.8S序列后,得到ITS1/2序列,并分析ITS1/2序列的遗传多样性;同时利用GenBank中已公布的异刺属(Heterakis) ITS1/2序列信息,进行系统发育研究.结果如下:59条鸡异刺线虫ITS1/2序列相似性较高(98.9％～100.0％),ITS1序列间变异较ITS2大;59条序列有20个变异位点和14个单倍型(H1～H14);四川种群具有丰富的单倍型多样性(Hd=0.532)和较低的核苷酸多样性(π=0.000 94);种群间基因交流频繁(Nm=31.72),群体遗传分化不明显(Fst=0.007 82),以群体内变异为主(AMOVA分析值=99.22％);从单倍型网络图及进化树(MP和ML)分析来看,7个地理种群未形成显著的地理种群结构,但四川整体种群曾经历过种群扩张(Tajima's D=-2.553 31,Fu's Fs=-10.564;P＜0.05);进化树(MP和ML)能有效区分鸡异刺线虫与属内其他虫种.四川7个地区鸡的鸡异刺线虫基因交流频繁,遗传多样性较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨光友	四川农业大学动物医学院	167	889	15.0	19.0
2	古小彬	四川农业大学动物医学院	55	257	8.0	13.0
3	赖为民	四川农业大学动物医学院	21	59	5.0	6.0
4	汪涛	四川农业大学动物医学院	9	39	4.0	6.0
5	郑晶		2	8	2.0	2.0
6	王保健	四川农业大学动物医学院	4	15	3.0	3.0
7	朱俊扬	四川农业大学动物医学院	2	6	2.0	2.0