牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用

• 作者: 任秀霞 张秀新 曾秀丽 李丹丹 杨勇 杨若雯 王顺利 薛璟祺
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牡丹 管家基因 系统发生 进化
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 观赏植物
• 页码范围: 307-319
• 分类号: S685.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0758

摘要

利用RT-PCR技术从牡丹组7个野生种和1个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因(ubiquitin,UBI)、素环蛋白基因(cyclophilin,CYP)、肌动蛋白基因(Actin)、葡萄糖六磷酸脱氢酶基因(glucose-6-phosphate l-dehydrogenase,G6PD)和β-微管蛋白基因(beta-tubulin,TUB)等5个管家基因的编码序列(coding sequence,CDS).序列比对分析发现,5个管家基因序列均相对保守,其在牡丹7个野生种和1个栽培种中的保守性在99.04％ ～ 99.69％.利用5个管家基因分别构建了其在牡丹组8份材料中的系统进化树.5个系统进化树均将8份材料分成两组,即革质花盘亚组和肉质花盘亚组;由于5个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同,在区分亚组成员间略有差异.综合分析5个管家基因构建的系统进化树可知,杨山牡丹(Paeonia ostii)和栽培牡丹(P.suffruticosa‘Luoyanghong’)常聚为一支,二者亲缘关系较近,因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成;紫斑牡丹(P.rockii)和四川牡丹(P.decomposita)一直聚为一支,推测二者亲缘关系较近;黄牡丹(P.lutea)和紫牡丹(P.delavayi)一直聚为一支,推测这二者亲缘关系较近.狭叶牡丹(P.potaninii)与黄牡丹和紫牡丹分化较早,结合前人研究结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种.