陆地棉 EPSPS 基因全基因组分析

• 作者: 倪万潮 巩元勇 徐珍珍 束红梅 蒋璐 郭书巧
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 陆地棉基因组 EPSPS 基因
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 15-21
• 页数: 7页
• 分类号: S562.01|Q78
• 字数: 4057字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.01.003

摘要

当前在 NCBI 中提交的来源于陆地棉的 EPSPS 基因有2个，随着陆地棉基因组测序结果的公布，为在陆地棉基因组中全面鉴定 EPSPS 基因的存在提供了便利条件。从陆地棉异源四倍体标准系 TM－1基因组数据库中共搜寻获得4个 EPSPS 同源基因，这4个基因分别分布在 A07、A12、D07和 D12亚基因组。从这4个基因的核苷酸序列、氨基酸序列和基因结构的比对，构建进化树的系统发育分析以及基因的转录情况研究来看，定位在 A07和 D07亚基因组的2个基因属于共线性高度同源基因，定位在 A12和 D12亚基因组的2个基因也是相同的情况。序列比对结果表明，已经在 NCBI 中提交的2个 EPSPS 基因分别是定位在 A12和 D12亚基因组上的基因，研究结果为定位在 A07和D07亚基因组上 EPSPS 基因的克隆和功能研究提供了基础理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭书巧	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	32	157	7.0	10.0
2	束红梅	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	22	91	5.0	8.0
3	巩元勇	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	17	46	4.0	5.0
4	徐珍珍	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	3	7	2.0	2.0
5	蒋璐	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	11	20	3.0	3.0