安阳地区2013年手足口病柯萨奇病毒A6 VP1基因特征研究

• 作者: 张相萍 李懿 李洋 翟明强 黄学勇
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒A6 系统发育树
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 324-330
• 页数: 7页
• 分类号: R392.9
• 语种: 中文

摘要

为了解2013年安阳地区手足口病病原谱组成特点及柯萨奇病毒A6 (CV-A6) VP1基因特征,采用实时荧光逆转录PCR方法对全年采集的临床手足口病例的479份粪便标本进行检测和分型,统计各型肠道病毒阳性标本数量及比例.对10份CV-A6阳性标本VP1基因进行扩增测序以获得全序列.使用BIOEDIT 7.2和MEGA 5.1软件对获得序列和NCBI数据库中检索到的参考序列进行VP1基因核苷酸、氨基酸相似性及系统发育分析.研究结果显示,检出肠道病毒阳性标本共429份,其中CV-A6阳性标本为90份,占全部阳性标本的比例为20.98％,这是安阳地区首次记录非CV-A16和EV-A71型肠道病毒列居手足口病病原谱第二位,成为手足口病主要病原之一.将成功获得的10条VP1序列与CV-A6原型株Gdula比较,发现安阳序列与Gdula VP1基因的核苷酸、氨基酸序列差异皆较大.与河南历史株HN421(2011)比较,发现有4条本地序列与HN421的核苷酸、氨基酸序列差异较大,其余6条与HN421差异较小.系统发育树显示,全部49条CV-A6序列共形成A、B、C、D四个分支.其中D分支可进一步分为D1和D2两个亚分支.安阳地区获得的10条CV-A6序列中,有6条属于D1亚分支,4条属于D2亚分支.