水稻干尖线虫翻译控制肿瘤蛋白基因的克隆及表达分析

• 作者: 李丹蕾 王博文 王峰 王步勇 陈俏丽 马玲
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻干尖线虫 翻译控制肿瘤蛋白基因(TCTP) 基因克隆 原位杂交 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 20-26
• 页数: 7页
• 分类号: S435.111.48|S432.1
• 字数: 4472字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2016.01.005

摘要

根据转录组测序结果,结合RT-PCR及RACE技术,从水稻干尖线虫中克隆出翻译控制肿瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)基因Ab-TCTP.该基因序列全长810 bp,开放阅读框长度为546 bp,编码181个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为20 930,等电点为4.68;Ab-TCTP蛋白属于稳定性蛋白,没有信号肽和跨膜区域,亚细胞定位于细胞核中;该蛋白功能区域的氨基酸序列较为保守,含有TCTP保守结构域,属于TCTP超家族(TCTP superfamily).多序列比对分析结果表明,Ab-TCTP蛋白与秀丽隐杆线虫TCTP蛋白(XP_003112086.1)的覆盖度为100％,相似度为78％.系统进化树分析结果表明,该蛋白与秀丽隐杆线虫TCTP蛋白(XP_003112086.1)在同一分支上,亲缘关系较近.原位杂交试验结果显示,杂交处理后的线虫在其食道腺附近颜色加深,TCTP基因主要在水稻干尖线虫的食道腺附近表达.利用鱼藤酮对水稻干尖线虫进行药剂处理试验,24 h时LC5o值为2.20 μg/mL.实时荧光定量PCR结果显示,鱼藤酮处理12h和24h后,TCTP基因的表达均上调,且处理24 h时的表达量大于处理12h时的表达量.推测该基因参与了水稻干尖线虫的应激反应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马玲	东北林业大学林学院	102	944	13.0	27.0
2	王博文	东北林业大学林学院	27	293	8.0	16.0
3	王步勇	东北林业大学林学院	14	82	4.0	9.0
4	李丹蕾	东北林业大学林学院	31	106	6.0	8.0
5	王峰	东北林业大学林学院	47	250	9.0	12.0
6	陈俏丽	东北林业大学林学院	26	83	6.0	7.0