茉莉酸信号受体COI蛋白家族的分子进化与基因表达分析

• 作者: 张园园 慕小倩 李文燕 段龙飞 郭邦利 陈国爱
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 茉莉酸信号 COI蛋白家族 系统发育 扩增与进化 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 146-155
• 页数: 10页
• 分类号: Q344+.13
• 字数: 5452字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2016.03.04

摘要

茉莉酸（ Jasmonic acid， JA）存在于所有高等植物中，是植物对病原微生物和虫害防御反应的关键激素。在茉莉酸信号转导中，COI1（ COR－insensitive 1）作为茉莉酸信号受体蛋白在其中发挥关键作用。本研究采用生物信息学方法，从藻类、苔藓类、蕨类、裸子及单、双子叶植物多谱系对COI蛋白家族进行比较基因组学研究，并取得以下结果：（1）同源基因鉴定结果发现，在所选的7种陆生植物中一共鉴定了55个COIs同源基因，然而，在低等的水生植物包括绿藻类（ Chlorophytes）、红藻类（Rhodophytes）、硅藻类（Bacillariophytes）、灰胞藻类（Glaucophytes）及褐藻类（Phaeophytes）等基因组中均未发现其同源基因；（2）系统进化树分析表明，植物COI蛋白家族可以分为4个保守的亚家族，且在陆生植物扩增的同时可能已发生功能分化；（3）基因结构分析显示，植物COI家族基因结构表现多样性，主要体现在内含子的数目和长度上；（4）基因表达数据提示，COI基因家族成员参与植物生长发育的多个时期，且在不同组织器官以及不同的胁迫应答反应中发挥不同的作用。以上结果将为植物COI基因家族的深入研究提供参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	慕小倩	西北农林科技大学生命科学学院	82	1758	22.0	40.0
2	郭邦利		14	28	4.0	4.0
3	张园园		8	19	2.0	4.0
4	陈国爱		11	19	2.0	3.0