鲑科鱼类线粒体全基因组序列结构特征及其系统发育信息分析

• 作者: 刘云国 刘凌霄 李瑶瑶 王敏强
• 来源期刊: 烟台大学学报（自然科学与工程版）
• 学科: 农学
• 关键词: 鲑科 线粒体基因组 结构特征 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 271-279
• 页数: 9页
• 分类号: S917.4|Q959.4
• 字数: 3728字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.2016.04.007

摘要

为了深入开展鲑科鱼类的线粒体全基因组序列的结构特征和系统发育信息的研究，利用生物信息学的方法分析了已获得的40种鲑科鱼类的线粒体全基因组序列.通过软件Clustal X进行对比，然后用软件MEGA5．05分析DNA的序列差异，并用邻接法生成系统进化树.结果发现：1)鲑科鱼类线粒体基因组的结构和基因排列顺序和其他硬骨鱼类的相同，其全长为16526~16997 bp.2)从系统进化树可以看出白鲑亚科( Coregoni-daeinae)位于祖先的位置，是最早出现分化的一枝，鲑亚科( Salmoninae)和茴鱼亚科( Thy-mallinae)亲缘关系较近，互为姐妹群.3)在所有编码基因中，序列变异程度最大的是ND2基因(47．6%)，最小的是16S rRNA基因(11．0)； Kimura双参数遗传距离最大的是ND2基因(0．203)，最小的是12S rRNA基因(0．037).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王敏强	烟台大学生命科学学院	32	215	8.0	14.0
2	李瑶瑶	烟台大学生命科学学院	8	12	2.0	3.0
3	刘云国	烟台大学生命科学学院	11	38	3.0	6.0
4	刘凌霄	烟台大学生命科学学院	4	6	1.0	2.0