检疫性疫霉DNA条形码筛选

• 作者: 国立耘 汪莹 王颖 程颖慧 章桂明 高瑞芳
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 检疫性疫霉 DNA条形码 遗传距离 条码间隔
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 213-222
• 页数: 10页
• 分类号: S412
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.2016.02.009

摘要

疫霉是世界关注的一类植物病原真菌.以疫霉属80个种122个菌株为研究材料,以ITS、CO1、EF-lα和β-tubulin4个基因片段为候选DNA条形码,分析表明ITS、CO1基因的PCR扩增和测序成功率最高,分别为100％和96.7％;ITS、CO1和β-tubulin存在明显的条码间隔,但种间、种内距离频率分布存在较小重叠;种间、种内遗传距离Wilcoxon秩和检验结果认为各基因对种内遗传距离的效力相等,对种间遗传距离的区分能力为ITS＞ COI＞β-tubulin.CO1基因和ITS片段可同时作为11种检疫性疫霉的首选DNA条形码,β-tubulin基因可作为辅助DNA条形码.