基于不同物种的热休克蛋白90的生物信息学分析

• 作者: 叶静 金殿川 陈伟
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 热休克蛋白90 系统发育树 基因结构 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 134-138
• 页数: 5页
• 分类号: Q811
• 字数: 2661字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2016.03.02

摘要

热休克蛋白90（ Heat shock protein 90，Hsp90）是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。 Hsp90包含Hsp90A， Hsp90B， Hsp90C， TRAP和HtpG5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况，验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律，即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种中，Hsp90B和TRAP1亚家族在物种间的分布无明显规律，Hsp90C亚家族只存在于植物中，HtpG亚家族大部分存在于细菌中。通过构建系统发育树，发现Hsp90家族在进化过程中具有保守性。使用Cell-PLoc， SubLoc v1．0， PSORT II和MultiLoc四种亚细胞定位软件对所选的11个物种的Hsp90进行亚细胞定位分析，发现Hsp90A，HtpG亚家族偏好出现在细胞质中，Hsp90B亚家族除存在于细胞质外还存在于内质网中，Hsp90C亚家族则集中于细胞质和线粒体中，TRAP1亚家族基本位于线粒体中。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟	华北理工大学理学院	15	10	2.0	3.0
2	叶静	华北理工大学理学院	2	5	1.0	2.0
3	金殿川	华北理工大学理学院	4	5	1.0	2.0