甘蓝型油菜结角高度与荚层厚度的全基因组关联分析

• 作者: 卢坤 唐章林 徐新福 曲存民 李加纳 梁颖 王腾岳 贺斌
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 全基因组关联分析 结角高度 结角层厚度 产量
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 344-352
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.000344

摘要

角果是油菜重要的光合作用和种子存储器官,对油菜产量具有重要贡献。本研究以412份具有代表性的甘蓝型油菜品种(系)为材料,利用芸薹属60K Illumina Infinium SNP芯片对其基因型分析,并对油菜结角高度和角果层厚度进行全基因组关联分析。结果共检测到16个显著关联的 SNP,其中重庆环境下分别检测到2个和4个 SNP与结角高度和结角层厚度显著关联,单个SNP解释的表型变异为5.61%~5.69%和5.94%~6.31%。云南环境下分别检测到5个和1个显著关联的SNP,单个标记解释的表型变异为12.66%~13.97%和22.43%。对2个环境的结角高度差和结角层厚度差共检测到3个和1个与性状显著相关的SNP,它们对表型变异的解释率分别为17.33%~20.32%和29.05%。其中,环境间结角厚度差的关联SNP与重庆环境结角层厚度的1个显著关联SNP位于同一LD区间。各显著关联标记LD区段的多个基因调节植物细胞组织发生、花分生组织发育、角果数目和多器官发育,如NSN1、TPST和SAC1等,它们可能通过上述功能影响油菜花序或角果的生长发育,导致结角高度或结角层厚度差异。本研究发掘的这些位点和候选基因可作为影响油菜结角高度和角果层厚度的重要候选区域和基因,为揭示油菜结角性状的遗传基础和分子机制,提高油菜单位面积产量奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李加纳	西南大学农学与生物科技学院	82	981	17.0	28.0
2	梁颖	西南大学农学与生物科技学院	23	165	8.0	12.0
3	唐章林	西南大学农学与生物科技学院	42	491	12.0	21.0
4	徐新福	西南大学农学与生物科技学院	17	123	6.0	10.0
5	卢坤	西南大学农学与生物科技学院	10	83	4.0	9.0
6	曲存民	西南大学农学与生物科技学院	9	112	7.0	9.0
7	王腾岳	西南大学农学与生物科技学院	2	26	2.0	2.0
8	贺斌		4	60	3.0	4.0