玉米新型氧甲基转移酶基因的全基因组鉴定、进化与表达研究

• 作者: 徐建红 范苗 陈铭
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 氧甲基转移酶(OMT) 基因复制 新功能化 苯并噁嗪 玉米
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1109-1119
• 分类号: Q946.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.08.001

摘要

利用生物信息学分析方法挖掘玉米(Zea mays)不同组织间差异表达的基因,揭示玉米生长发育过程的分子机理,本研究从NCBI数据库中下载获得玉米自交系Mo17和B73根和芽的转录组数据,发现了5个在根中高表达的氧甲基转移酶(O-methyltransferase,OMT)基因,在B73全基因组中鉴定到另外的23个拷贝.对玉米的28个氧甲基转移酶基因的结构、保守模体以及进化分析表明,其不同于咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因和咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶(caffeoyl coenzyme A 3-O-methyltransferase,CCoAOMT)基因,是一类新型的氧甲基转移酶基因家族.这类基因家族含有5个进化分支,其中有两个进化分支分别包含苯并噁嗪类基因7(benzoxazinless 7,Bx7)和Bx10,参与苯并噁嗪类物质的生物合成,表明该类基因在玉米的抗病虫反应中发挥着重要作用.染色体结构与进化分析表明,这类新型氧甲基转移酶基因家族的扩增大多是通过串联重复和片段复制来实现的.对这些基因在玉米的巢式关联定位(nested association mapping,NAM)群体亲本中的表达模式分析表明,其表达模式十分复杂.该研究结果为进一步了解COMT基因的生物学功能及其利用提供了理论依据和参考,并对研究该基因家族的催化机制及其表达调控模式具有重要的指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈铭	浙江大学生命科学学院	21	32	4.0	5.0
2	徐建红	浙江大学农业与生物技术学院	21	132	5.0	11.0
3	范苗	浙江大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0