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大黄属(蓼科)植物ndhF基因的适应性进化
大黄属(蓼科)植物ndhF基因的适应性进化
作者:
刘合霞
李景剑
毛世忠
赵博
黄仕训
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大黄属(蓼科)
ndhF基因
分支模型
位点模型
正选择位点
摘要:
大黄属(Rheum L.)是蓼科(Polygonaceae)中一个高度分化的大属,广泛分布在亚洲和欧洲的高山和沙漠地区,全世界约60种,其中在青藏高原及其邻近地区发现了约40种。该属种的高度分化曾被推测是第三纪末青藏高原的快速隆升以及第四纪气候的反复变化所引发的适应性辐射导致。为进一步了解大黄属植物辐射式物种分化的分子适应机制,该研究选取34个形态上多样化的大黄属物种,利用系统发育分析软件,在时间框架下采用位点模型和分支模型对大黄属的叶绿体ndhF基因进行了适应性进化分析。结果表明:大黄属植物的分子进化系统树呈现短而平行的辐射式分支式样,显示出典型的物种快速辐射多样化特征;用位点模型检验ndhF基因是否存在经受正向选择(ω>1)时,在氨基酸水平上共鉴定出3个NDHF亚基的正选择位点(188H,465H,551L),对NDHF亚基的二级结构进行分析后发现编码的188H氨基酸位于α螺旋上。大黄属植物可能通过这些结构域的适应性进化,适应青藏高原的快速隆升以及第四纪气候的反复变化而引发的陆地生态系统改变。该研究结果可为今后对该属植物的实验分析提供首选位点。
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文献信息
篇名
大黄属(蓼科)植物ndhF基因的适应性进化
来源期刊
广西植物
学科
生物学
关键词
大黄属(蓼科)
ndhF基因
分支模型
位点模型
正选择位点
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
进化系统学专栏
研究方向
页码范围
101-106
页数
6页
分类号
Q941.2
字数
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw201508017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
黄仕训
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
28
165
8.0
11.0
2
毛世忠
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
10
54
5.0
7.0
3
赵博
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
3
14
2.0
3.0
5
刘合霞
广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
4
6
2.0
2.0
6
李景剑
华南农业大学林学与风景园林学院
5
7
2.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
引证文献
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同被引文献
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二级引证文献
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1985(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1989(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1993(1)
参考文献(1)
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1997(1)
参考文献(1)
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2001(1)
参考文献(1)
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2002(1)
参考文献(1)
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2003(1)
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2005(3)
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2007(1)
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2009(2)
参考文献(2)
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2011(1)
参考文献(1)
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2012(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2016(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2018(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大黄属(蓼科)
ndhF基因
分支模型
位点模型
正选择位点
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
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