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水生生物DNA序列相似度的算法
水生生物DNA序列相似度的算法
作者:
于喆
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
DNA序列相似度指标
水生生物
MonteCarlo模拟
摘要:
本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法.首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类.利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性.理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类.模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征.
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篇名
水生生物DNA序列相似度的算法
来源期刊
水产学杂志
学科
农学
关键词
DNA序列相似度指标
水生生物
MonteCarlo模拟
年,卷(期)
2016,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
22-26
页数
5页
分类号
S917
字数
4364字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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于喆
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水生生物
MonteCarlo模拟
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研究来源
研究分支
研究去脉
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水产学杂志
主办单位:
中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3832
CN:
23-1363/S
开本:
16开
出版地:
哈尔滨市道里区河松街232号
邮发代号:
创刊时间:
1988
语种:
chi
出版文献量(篇)
1280
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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