基于样本熵的DNA序列相似性分析

• 作者: 万力超 周小安
• 来源期刊: 智能计算机与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 样本熵 DNA序列 序列相似性 DTW距离
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 101-103
• 页数: 3页
• 分类号: TP391
• 字数: 2707字
• 语种: 中文

摘要

针对传统方法在分析DNA序列相似性方面的不足,提出了一种基于样本熵的DNA序列相似性分析方法.以5种东亚钳蝎神经毒素的基因序列作为分析对象,首先通过DNA序列的图形表示把DNA序列转换为时间序列,然后运用样本熵算法计算出时间序列的样本熵值,将样本熵的互值大小作为分析序列之间相似性的依据,最后将样本熵方法与DTW(Dynamic Time Warping,动态时间弯曲)方法的实验结果进行比较.实验结果表明,样本熵分析方法能有效分析序列之间的相似性,与DTW分析方法相比较,显示出更强的相似性和区别度,可将其进一步应用于生物序列的分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周小安	深圳大学信息工程学院	20	39	4.0	5.0
2	万力超	深圳大学信息工程学院	2	1	1.0	1.0