槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

• 作者: 叶鼎承 张金耀 杨建敏 林威敏 肖天放 胡宇平 黄守婷
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 槐猪 杜洛克猪 背最长肌 差异表达 转录组测序
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 192-195
• 页数: 4页
• 分类号: S828|S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2016.02.012

摘要

为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36177844和34496450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71％和80.09％.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体( GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖天放	福建农林大学动物科学学院	38	246	9.0	14.0
2	叶鼎承	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	39	243	8.0	14.0
3	林威敏	福建农林大学动物科学学院	4	7	1.0	2.0
4	杨建敏	福建农林大学动物科学学院	5	8	2.0	2.0
5	胡宇平	福建农林大学动物科学学院	3	7	1.0	2.0
6	张金耀	福建农林大学动物科学学院	6	9	2.0	3.0
7	黄守婷	福建农林大学动物科学学院	9	12	2.0	3.0