裸子植物psbA基因分子进化式样的研究

• 作者: 余坤 刘合刚 徐雷 森林 汪文杰 潘宏林 胡志刚
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 裸子植物 响应 机制 放松分子钟模型 适应性进化 共进化
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 151-159
• 页数: 9页
• 字数: 5127字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/j.issn.1005-3395.2016.02.004

摘要

为阐明裸子植物对陆生生境生态响应的分子机制,以新近的裸子植物分类系统为指导,基于psbA基因编码全序列对4亚纲53种代表植物进行分子进化分析.首先,依据“放松分子钟”模型重建裸子植物在时间尺度下系统发育关系;其次,采用6个模型(MEC/JTT、MEC/cpREV、M5、M7、M8、M8a)估测氨基酸位点ω值,并对各模型结果进行统计检测;随后,利用Bootstrap方法检PSBA蛋白内部氨基酸位点的共进化动态.结果表明,系统树提示的物种分化历程支持前期分类结果;光合系统反应中心核心PSBA蛋白有3个氨基酸位点(13、19和243)曾经受正选择压力;PSBA蛋白内部有多对氨基酸位点间构成了共进化网络.因此,sbA基因编码序列具有作为描绘裸子植物系统发育关系标记的潜力,PSBA蛋白部分位点经历了适应性进化,通过位点间共进化网络协同作用方式辅助裸子植物响应陆生生境.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡志刚	湖北中医药大学药学院	34	133	7.0	10.0
2	刘合刚	湖北中医药大学药学院	55	390	11.0	16.0
3	汪文杰	湖北中医药大学药学院	15	36	4.0	5.0
4	潘宏林	湖北中医药大学药学院	17	138	5.0	11.0
5	徐雷	湖北中医药大学药学院	23	63	5.0	6.0
6	森林	湖北中医药大学中药资源与中药复方教育部重点实验室	6	10	2.0	3.0
10	余坤	湖北中医药大学中药资源与中药复方教育部重点实验室	18	22	3.0	4.0