16S rRNA及rpoC1基因用于螺旋藻、节旋藻系统发育的比较

• 作者: 吴跃梅 王素英 董世瑞
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 螺旋藻 节旋藻 16S rRNA rpoC1 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 232-240
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150227

摘要

[目的]利用16S rRNA和rpoC1基因分子标记研究螺旋藻、节旋藻的系统发育关系,并对其区分能力进行比较.[方法]以84株螺旋藻、节旋藻为研究对象,对其进行16S rRNA、rpoC1基因序列的扩增、测序及分析,并对构建的系统发育树进行对比.[结果]rpoC1基因序列保守位点所占比例49.7％、平均G+C百分含量47.7％和序列相似度76％-100％明显低于16S rRNA基因序列的79.4％、55.6％和91％-100％,其变异程度高于16S rRNA基因;基于16S rRNA、rpoC1基因构建的系统发育NJ树拓扑结构基本一致,84株实验藻株分为2个属3个类群,其中仅F-351、F-904-2、F-1070和TJBC14-1藻株为螺旋藻,其余均为节旋藻;虽然2个基因都不能区分形态种和地理种,但rpoC1基因NJ树的置信度(100％)高于16SrRNA基因(99％),属内分群效果也明显优于16S rRNA基因.[结论]支持了螺旋藻、节旋藻为两个不同属的结论,且在属内分类时rpoC1基因比16S rRNA基因具有更高的区分度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王素英	天津市食品生物技术重点实验室天津商业大学生物技术与食品科学学院	17	63	5.0	6.0
2	董世瑞	天津市食品生物技术重点实验室天津商业大学生物技术与食品科学学院	7	30	4.0	5.0
3	吴跃梅	天津市食品生物技术重点实验室天津商业大学生物技术与食品科学学院	1	3	1.0	1.0