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de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征
de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征
作者:
BJ(O)RN Lars Olof
宁婵娟
李韶山
耿妍
陈玲玲
鲁焕
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
de novo
转录组
五爪金龙
生物入侵
代谢
摘要:
为探究华南地区严重入侵植物五爪金龙(Ipomoea cairica)生物入侵的分子机制,对五爪金龙及其近缘种七爪金龙(I.digitata)和裂叶牵牛(I.nil)进行de novo转录组测序和组装,得到56551条unigenes,其中56522条得到注释,7815条GO注释,15615条COG注释,180201条KEGG数据库注释.转录组分析结果表明,五爪金龙氮代谢通路关键酶基因的表达高于对照.次生代谢关键酶(PAL、4CL、CAD、查耳酮合酶、苯基丙乙烯酮异构酶、槲皮黄3-O-甲基转移酶等)基因在五爪金龙与七爪金龙及裂叶牵牛中均得到协同性的差异表达,而这些代谢通路指导的产物合成对五爪金龙的抗逆境能力、生长、化感作用等均起关键作用.关键基因的RT-qPCR验证结果与转录组结果具有一致性.因此,这从分子生物学层面上对解释五爪金龙在华南地区的入侵机制提供了新的证据.
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篇名
de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征
来源期刊
热带亚热带植物学报
学科
关键词
de novo
转录组
五爪金龙
生物入侵
代谢
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
植物生理与分子生物学
研究方向
页码范围
128-142
页数
15页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11926/j.issn.1005-3395.2016.02.002
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研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
热带亚热带植物学报
主办单位:
中国科学院华南植物园
广东省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3395
CN:
44-1374/Q
开本:
大16开
出版地:
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2032
总下载数(次)
6
总被引数(次)
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