目标区域捕获测序检测到一视网膜色素变性家系ABCA4基因新突变

• 作者: 丁思加 盛迅伦 赵堪兴 赵晨 陈雪
• 来源期刊: 中华眼视光学与视觉科学杂志
• 关键词: 视网膜炎,色素性 ABCA4基因 高通量二代测序 基因突变
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传眼科学
• 页码范围: 142-147
• 页数: 6页
• 字数: 4843字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1674-845X.2016.03.004

摘要

目的 研究我国一个常染色体隐性遗传的视网膜色素变性(RP)家系患者的临床表型及致病基因突变,并分析表型与基因型间的关系.方法 实验研究.收集了宁夏人民医院眼科诊治的一个RP家系的临床资料,共有7名家庭成员参与研究,其中包括2名患者和5名正常成员.完善家系内所有参与成员的眼科检查,包括最佳矫正视力(BCVA)、视野、眼底照相、光学相干断层扫描(OCT)及全视野视网膜电流图(ERG)等.针对180个已知的遗传性视网膜疾病致病基因及9个高度可疑的候选基因设计目标区域捕获芯片,利用该捕获芯片对先证者(Ⅳ-4)进行目标区域内的高通量二代测序,借助优化的生物信息学分析对捕获的遗传变异进行筛查过滤,最终通过家系内共分离验证确认致病突变,进一步分析该突变与患者表型间的关系.结果 临床检查结果表明该家系内的2名患者的临床表现均符合典型的RP改变,遗传学分析结果证实了ABCA4基因c.419G＞A突变是该家系的致病突变.该突变导致了ABCA4基因所编码的蛋白第140号氨基酸由精氨酸变为谷氨酰胺(p.Arg140Gln),保守性分析显示该突变位点在各物种中高度保守,PloyPhen-2软件预测结果表明该突变具有较高的致病性.结论 本研究借助基于高通量二代测序平台的目标区域捕获测序,首次发现了ABCA4基因新突变p.Arg140Gln是一个常染色体隐性遗传RP家系的致病突变,进一步扩充了ABCA4基因的遗传突变谱及表型谱.