染色体微阵列分析技术在核型正常的骨骼系统发育异常患儿中的应用研究

• 作者: 廖灿 张永玲 李茹 杨昕 潘敏 甄理 符芳 郭乔丽 韩瑾
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 关键词: 染色体微阵列分析 拷贝数变异 骨骼系统发育异常 基因型-表型关系分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 306-311
• 页数: 6页
• 字数: 5702字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2016.03.006

摘要

目的 探讨染色体微阵列分析技术(chromosome microarray analysis,CMA)在核型正常的骨骼系统发育异常(skeletal anomalies,SA)患儿中的应用价值.方法 选取2012年6月至2015年5月因骨骼系统发育异常伴或不伴有其他异常而到广州市妇女儿童医疗中心就诊的43例患儿.所有患儿均行常规G显带染色体核型分析,核型结果正常者按照美国Affymetrix公司CytoScan 750K芯片的标准操作流程进一步行全基因组CMA检测,并通过配套的CHAS软件及相关的生物信息学方法分析检测结果.结果 43例患儿中,染色体核型分析发现2例患儿染色体核型异常,核型异常比例为4.65％.41例核型结果正常的患儿进一步行全基因组CMA检测.在CMA检测的患儿中,分为单纯SA组17例,SA合并精神运动发育迟缓组6例,SA合并其他系统结构畸形组18例.CMA检测结果提示9例患儿基因组发生了致病性拷贝数变异(copy number variations,CNVs),致病性CNVs的总体检出率为21.95％.其中,单纯SA组、SA合并精神发育迟缓组以及SA合并其他系统结构畸形组的致病性CNVs检出率分别为17.65％(3/17)、33.33％(2/6)以及22.22％(4/18)[P=0.576(17.65％ vs.33.33％)、P=1.000(17.65％ vs.22.22％)和P=0.618(33.33％ vs.22.22％),Fisher's检验].结论 全基因组高分辨率CMA技术在核型正常的骨骼系统发育异常患儿中能够将致病性检出率额外提高了21.95％,建议染色体核型结果正常的骨骼系统发育异常患者进一步行CMA检测.单纯SA组、SA合并精神运动发育迟缓组以及SA合并其他结构畸形组之间其致病性CNVs检出率没有统计学差异.