基于 bchY 的内蒙古2个盐碱湖中不产氧光合细菌多样性的分析

• 作者: 冀锦华 冯福应 刘柯澜 宝力德
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 盐碱湖 不产氧光合细菌(APB) bchY 基因 cutoff 值 OTUs 系统发育分析 多样性 基因克隆文库
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 147-154
• 页数: 8页
• 分类号: Q938.1
• 字数: 6087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.03.022

摘要

为进一步了解和认识 APB 及其在盐碱湖中的生态功能及其作用机制，通过构建和分析不产氧光合细菌bchY 基因克隆文库，揭示其中不产氧光合细菌的多样性、群落结构及其与生存环境的关系。样品采自内蒙古浑善达克沙地盐碱度较高的扎格斯台和达格淖2个湖的水样，提取了样品总 DNA。以 bchY 作为检测 APB 的通用标记，用PCR 扩增方法构建了其 bchY 文库，并对扩增产物进行了测序与系统发育分析。结果表明，达格淖湖和扎各斯台湖均为富营养化盐碱湖，且两湖盐度相差很大。利用 bchY 文库中核酸序列对应的氨基酸序列进行分析，两文库覆盖度均达93．0％以上，代表性较强，共得到108条 bchY 编码的氨基酸序列，以 cutoff ＝0．03和0．12分别在种和属水平进行同源性和系统发育分析，在 cutoff ＝0．03分为17个 OTUs。两湖的多样性指数（Shannon-Weaver 和 Simpson）和均匀度指数（Evenness）较接近，其种群多样性程度和均匀程度比较相似，但二者的 Chao1都不太高，说明两湖 APB 的多样性较低，种群不丰富。达格淖湖的 Margalef 指数较高，说明前者物种数目比后者多。两湖的不产氧光合细菌均属 Alpha-proteobacteria 纲，最优势菌群均为 Roseibacterium elongatum。同源性及系统发育性分析表明，达格淖湖和扎各斯台湖中不产氧光合细菌的主要类型为 AAPB-like 类群、多样性低。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯福应	内蒙古农业大学生命科学学院	37	261	9.0	14.0
2	宝力德	内蒙古农业大学生命科学学院	12	77	5.0	8.0
3	冀锦华	内蒙古农业大学生命科学学院	4	8	1.0	2.0
4	刘柯澜	内蒙古农业大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0