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荔枝蒂蛀虫转录组及嗅觉相关基因分析
荔枝蒂蛀虫转录组及嗅觉相关基因分析
作者:
刘慧
孟翔
欧阳革成
胡俊杰
郭明昉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
荔枝蒂蛀虫
转录组
高通量测序
基因注释
嗅觉基因
摘要:
[目的]荔枝蒂蛀虫Conopomorpha sinensis Bradley是专一性危害我国华南地区荔枝和龙眼的重要害虫,隐蔽性强,防治困难,基因组信息缺乏.本研究的目的是获得荔枝蒂蛀虫的基因数据,寻求有效控制害虫的分子靶标.[方法]采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeqTM 4000对荔枝蒂蛀虫进行转录组测序和生物信息学分析.[结果]经序列拼接获得68 996条unigenes.进一步利用七大公共数据库进行同源比对,注释了22 348 unigenes.注释到Nr数据库的unigenes数量最多,达27.01%,其中Nr注释的荔枝蒂蛀虫unigenes中与小菜蛾Plutella xylostella unigenes同源性最高,达34.1%.将unigenes与GO数据库比对发现,15 585条unigenes根据其功能大致可分为3类47亚类.KEGG pathways分析表明,7 272条unigenes定位为267个代谢通路.基因注释进一步筛选鉴定获得100个荔枝蒂蛀虫嗅觉相关基因;与鳞翅目相关气味结合蛋白基因联合分析发现,与荔枝蒂蛀虫气味结合蛋白基因直系同源的有18组,部分基因形成独立一簇.[结论]本研究首次获得了荔枝蒂蛀虫的转录组数据,研究结果为生物控制荔枝蒂蛀虫提供了重要的基础数据和候选分子靶标.荔枝蒂蛀虫独有的气味结合蛋白基因可能与其生境中特有的化学物质相关.
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文献信息
篇名
荔枝蒂蛀虫转录组及嗅觉相关基因分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
荔枝蒂蛀虫
转录组
高通量测序
基因注释
嗅觉基因
年,卷(期)
2016,(8)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
823-830
页数
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2016.08.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
胡俊杰
广州大学生命科学学院
7
35
3.0
5.0
2
孟翔
1
15
1.0
1.0
3
刘慧
2
18
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2.0
4
欧阳革成
3
20
2.0
3.0
5
郭明昉
广东省生物资源应用研究所广东省野生动物保护与利用公共实验室
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2016(1)
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二级引证文献(17)
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引证文献(1)
二级引证文献(8)
研究主题发展历程
节点文献
荔枝蒂蛀虫
转录组
高通量测序
基因注释
嗅觉基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
49239
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