水牛Sohlh2基因的克隆分析及其表达

• 作者: 朱鹏 李海洋 杨素芳 石德顺 苏节 陈凤 陈集成 韦英明
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水牛 Sohlh2基因 克隆分析 表达
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医?水产养殖
• 页码范围: 399-407
• 页数: 9页
• 分类号: S823.8+3
• 字数: 5188字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2016.02.025

摘要

为阐明广西沼泽型水牛Sohlh2基因在水牛不同组织中的表达规律，根据GenBank已公布的牛Sohlh2基因序列，设计其编码区（ CDS）扩增引物，应用RT?PCR方法扩增克隆获得目的基因片段；应用生物信息学方法，系统分析了水牛Sohlh2的遗传进化以及蛋白质的理化性质、二级和三级结构；并应用RT?QPCR技术对Sohlh2基因在水牛组织（器官）的表达进行了分析。结果表明：水牛Sohlh2基因编码区全长1281 bp，共编码426个氨基酸。多重序列比较分析结果显示水牛 Sohlh2核苷酸序列与牛、绵羊、山羊、猪、马、人和小鼠相应序列的相似性分别为98％、96％、96％、85％、86％、81％和72％，系统进化树显示Sohlh2基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。 Sohlh2蛋白质呈弱碱性，无信号肽，在细胞中亚定位于细胞核中，存在bHLH结构。水牛Sohlh2基因在水牛垂体、大脑、肝脏、骨骼、卵巢和睾丸等11个组织（器官）细胞中具有不同程度的表达，其中睾丸细胞中表达量最高，垂体和生殖脊细胞中表达量次之，卵丘细胞中表达量低，心脏、肺脏、肌肉细胞和颗粒细胞中不表达。