烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析

• 作者: 刘贯山 吴华 晁江涛 杨明磊 王大伟 胡军华 龚达平
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: C2H2锌指蛋白转录因子 烟草 基因家族
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 337-349
• 页数: 13页
• 字数: 6586字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.15-440

摘要

C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程.植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用.本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组数据库,运用Blastp比对,结合Pfam和SMART分析,鉴定了118条普通烟草C2H2锌指蛋白家族成员;对烟草C2H2锌指蛋白家族进行了进化树分析、结构域分析、物理化学性质分析、染色体定位、基因结构分析、三维结构分析及组织表达分析等.结果表明:不同成员的氨基酸长度差异较大;系统进化及结构域分析显示,所有C2H2家族成员可以被分为5个亚家族,同一亚家族成员之间在结构域和理化性质上呈现较高一致性;每个成员都含有C2H2结构域,在数量上存在较大差异;将所有基因家族成员定位在22条染色体上;组织表达分析表明,每个C2H2亚家族都有成员在不同组织中表达,在叶及根中有些基因的表达量较高.