HMGB1基因SNP位点实时荧光PCR检测方法的建立

• 作者: 刘健平 刘胜牙 朱玉兰 甄胜西 谢聪贤
• 来源期刊: 中国热带医学
• 学科: 医学
• 关键词: TaqMan探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性 高迁移率族蛋白1基因
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 957-960
• 分类号: R318.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2016.10.03

摘要

目的 建立基于TaqMan探针实时荧光PCR技术的高迁移率族蛋白1(high mobility group box-1 protein,HMGB1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测方法.方法 收集2014年4月在深圳口岸医院体检的健康人群样本20份,选择HMGB1基因上的2个SNP位点设计常规PCR和实时荧光PCR扩增引物和TaqMan探针,采用基因测序和实时荧光PCR方法对样本进行SNP分型.结果 实时荧光PCR方法SNP分型结果显示,在20份样本中的HMGB1基因rs1412125位点检测到TT基因型11例,CC基因型1例,TC基因型8例;HMGB1基因rs3742305位点检测到GG基因型15例,GC基因型5例,未发现CC基因型.这一结果与基因测序方法结论完全一致.结论 基于TaqMan探针技术的实时荧光PCR方法进行HMGB1基因SNP分型简单、快速、高效,可用于人群大规模样本的SNP筛查,具有广泛应用的价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱玉兰		31	102	7.0	8.0
3	刘胜牙		14	8	1.0	2.0
9	甄胜西		11	13	2.0	3.0
13	谢聪贤		6	0	0.0	0.0
17	刘健平		1	0	0.0	0.0