基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
目的:寻找一种可同时调控白细胞介素-12A(IL-12A)等多个单纯疱疹性角膜炎(HSK)免疫调节因子的microRNA(miRNA)。鉴定miRNA与IL-12A等免疫调节因子的靶向调控作用并预测其在HSK中可能的作用机制。方法选取293T人胚肾细胞等培养材料进行实验。实验主要包括运用TargetScan v7.1、miRanda v2010、miRBase v2014及miRTarBase v6.0数据库进行多个免疫调节因子的miRNA预测,寻找共同的miRNA;运用miRBase数据库对各物种miR-21序列进行对比;通过RGator v3.0数据库分析hsa-miR-21在各组织中的表达情况;通过数据库检索,找出尚未验证的hsa-miR-21候选靶基因进行结合位点验证;通过构建IL-12A的3′-非翻译区( UTR)野生型及突变型载体质粒,将相应的质粒与hsa-miR-21模拟物转染到293T细胞中;通过双荧光素酶报告系统检测萤光素酶活性,初步验证两者的靶向结合作用;运用以上数据库进行hsa-miR-21的候选靶基因预测,得出候选靶基因集合;对候选靶基因集合进行基因功能富集分析和信号转导通路富集分析,并预测hsa-miR-21在HSK中可能的作用机制。结果通过以上数据库检索,发现hsa-miR-21是可以同时调控以上多个HSK免疫调节因子的miRNA,且各物种miR-21的序列基本一致。研究发现IL-12A是尚未验证的候选靶基因。双荧光素酶报告系统分析表明hsa-miR-21能够靶向作用于IL-12A的3′-UTR (t=-24.43,P<0.05),初步证明两者有靶向结合作用。结合数据库筛选出hsa-miR-21的候选靶基因共609个,其基因功能主要富集于调节细胞、细胞蛋白质代谢等过程( P<0.05),并涉及到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路、单纯疱疹感染通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、NF-κB信号通路及多种癌症通路( P<0.05)。研究结果表明,hsa-miR-21可能通过MAPK信号转导通路中的27个靶基因、单纯疱疹感染通路中的19个靶基因、TNF信号通路中的15个靶基因及NF-κB信号通路中的10个靶基因来调控HSK的发生和发展。结论 HSK免疫调节因子IL-12A等多个靶基因可同时被hsa-miR-21调节。 hsa-miR-21的靶基因参与多个生物学过程,与癌症和免疫炎症密切相关,其中MAPK信号转导通路、单纯疱疹感染通路、TNF信号通路及NF-κB信号通路可能是其参与HSK免疫调节中主要的作用机制。
推荐文章
单纯疱疹性角膜炎发病机理的现代研究
单纯疱疹性角膜炎
发病机理
鱼腥草滴眼液治疗单纯疱疹性角膜炎的实验研究
鱼腥草滴眼液
单纯疱疹性角膜炎
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 单纯疱疹性角膜炎免疫调节因子 IL-12 A与 microRNA-21靶向作用关系的实验研究
来源期刊 中华眼科医学杂志(电子版) 学科
关键词 MicroRNA-21 白细胞介素-12A 单纯疱疹性角膜炎 生物信息学 双荧光素酶报告系统
年,卷(期) 2016,(5) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 219-226
页数 8页 分类号
字数 6527字 语种 中文
DOI 10.3877/cma.j.issn.2095-2007.2016.05.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 夏丽坤 中国医科大学附属盛京医院眼科 54 233 8.0 12.0
2 刘鹤南 中国医科大学附属盛京医院眼科 50 188 7.0 10.0
3 张帆 中国医科大学附属盛京医院眼科 22 119 6.0 10.0
4 曹楠珏 中国医科大学附属盛京医院眼科 5 15 2.0 3.0
5 张小娟 中国医科大学附属盛京医院眼科 4 6 2.0 2.0
6 强薇 中国医科大学附属盛京医院眼科 4 6 2.0 2.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (23)
共引文献  (16)
参考文献  (42)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1974(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1989(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
1992(4)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(3)
1993(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1996(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
1997(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1998(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
1999(3)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(2)
2000(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2001(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2002(4)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(3)
2003(4)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(2)
2004(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2005(4)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(0)
2007(6)
  • 参考文献(6)
  • 二级参考文献(0)
2009(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2010(5)
  • 参考文献(5)
  • 二级参考文献(0)
2011(5)
  • 参考文献(5)
  • 二级参考文献(0)
2012(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2013(3)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(0)
2014(5)
  • 参考文献(5)
  • 二级参考文献(0)
2016(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2016(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
MicroRNA-21
白细胞介素-12A
单纯疱疹性角膜炎
生物信息学
双荧光素酶报告系统
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华眼科医学杂志(电子版)
双月刊
2095-2007
11-9311/R
16开
北京市东城区东交民巷1号
2011
chi
出版文献量(篇)
820
总下载数(次)
2
论文1v1指导