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新疆北部主要盐生植物根部内生细菌群落结构的高通量分析
新疆北部主要盐生植物根部内生细菌群落结构的高通量分析
作者:
吴国华
周娜
张科
田长彦
赵帅
赵振勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
盐生植物
内生细菌
多样性
焦磷酸测序
摘要:
[目的]揭示同一盐渍环境中不同种盐生植物根部内生细菌群落多样性特征和分布规律,结合根际土壤理化因子探讨其对内生细菌群落结构的影响.[方法]通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16SrRNA片段,然后进行生物信息分析.[结果]研究的16种盐生植物其内生细菌群落主要由Proteobacteria、Tenericutes、Actinobacteria和Firmicutes 4个门的细菌组成.从植物“种”的水平来看,不同种盐生植物内生细菌群落存在差异;从植物“属”的水平来看,同一属的盐生植物内生细菌相似;从植物“科”的水平来看,藜科盐生植物内生细菌以Actinobacteria和Proteobacteria门为主;蒺藜科盐生植物内生细菌以Proteobacteria门为主;柽柳科盐生植物内生细菌以Tenericutes门为主;白花丹科盐生植物内生细菌以Proteobacteria、Fimicutes和Actinobacteria门为主.根际土壤中C1-含量对盐生植物内生细菌群落变化具有显著影响;而Cl-、Mg2+和总氮组成的集合与内生细菌群落结构相关性最高.[结论]盐生植物内生细菌多样性丰富.在同一盐渍生境中,盐生植物内生细菌群落分布呈现宿主的种属特异性,根际土壤中C1-是影响其内生细菌群落变化的主要驱动因素之一.
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蕙兰
内生细菌
群落结构
ARDRA
16S
rDNA
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文献信息
篇名
新疆北部主要盐生植物根部内生细菌群落结构的高通量分析
来源期刊
微生物学报
学科
关键词
盐生植物
内生细菌
多样性
焦磷酸测序
年,卷(期)
2016,(10)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1583-1594
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20150616
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
赵振勇
中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室
44
584
16.0
23.0
2
张科
中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室
46
329
11.0
17.0
3
赵帅
中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室
23
130
6.0
11.0
4
周娜
中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室
8
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研究去脉
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微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
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