干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究

• 作者: 丁国华 夏天舒 姜树坤 孙世臣 孙健 张凤鸣 杨光 沈希宏 王彤彤 白良明 郑洪亮 陈温福 马殿荣
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 杂草稻 根系 表达谱芯片 耐旱
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 458-468
• 页数: 11页
• 分类号: Q786|Q945.78
• 字数: 8753字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16819/j.1001-7216.2016.5180

摘要

利用 Affymetrix 水稻表达谱芯片(GeneChip Rice Genome Array)研究抗旱杂草稻 HEB07-2与巴西陆稻(IAPAR9)在 PEG 模拟干旱胁迫下根系基因表达变化。结果表明,杂草稻 HEB07-2转录组对干旱信号的响应程度与方向均与巴西陆稻存在很大差异,HEB07-2以正向调控为主,而巴西陆稻以负调控为主。干旱胁迫下杂草稻 HEB07-2与巴西陆稻分别有6878个和2923个基因表达,其中 HEB07-2受干旱胁迫诱导上调的基因有4693个,下调的基因有2185个；而巴西陆稻则分别有983个和1940个。在差异基因表达的倍数上也是 HEB07-2高于巴西陆稻。进一步的 GO 分析表明,在干旱胁迫下, HEB07-2和 IAPAR9根系基因响应途径的差异表现为 HEB07-2在钾离子转运(GO：0006813)、次生物质代谢(GO：0019748)、细胞生长(GO：0016049)、葡萄糖代谢(GO：0006006)、跨膜离子转运器活性(GO：0015075)、亚铁血红素结合体(GO：0020037)、氧化还原酶活性(GO：0016491)等方面基因显著上调,这与生理数据和表型数据一致。