心肌层表达tRNA源性小片段RNA

• 作者: 蔡冬青 许甘霖 齐绪峰
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: tRFs 小片段RNA 左心室前壁 心肌梗死
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 907-911
• 页数: 5页
• 分类号: Q522
• 字数: 2266字
• 语种: 中文

摘要

目的 研究大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)是否存在转移核糖核酸来源的小片段RNA(tRFs)的表达.方法 分离出大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织并提取总RNA.使用Illumina技术对小片段RNA进行测序,以获的该两个区域的50 nt以下小片段RNA的序列及表达量信息.利用Fstax和Bowtie软件,及Perl语言编程对长度为30 ～ 36 nt部分的小片段RNA进行注释,并比较两个区域tRF表达量差异.结果 大鼠心脏左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织存在tRF表达,而来源于tRNA的tRFs分别占总小片段RNA的9.15％和7.30％.且两个区域的经鉴别的28中tRFs种类及表达量十分接近.无论是相当于梗死区还是相当于边缘区的心肌组织,GlyGCC和ValCAC两个tRNA来源的tRFs占了所有tRFs的84.73％和84.66％.每一种tRNA来源的tRFs在两个区域间的表达差异小于4％.结论 生理状态下心肌组织存在tRF表达,相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区的心肌tRFs表达谱是十分接近的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡冬青	暨南大学再生医学教育部重点实验室科技部及广东省国际科技合作基地发育与再生生物学系	9	33	3.0	5.0
2	许甘霖	暨南大学再生医学教育部重点实验室科技部及广东省国际科技合作基地发育与再生生物学系	2	4	1.0	2.0
3	齐绪峰	暨南大学再生医学教育部重点实验室科技部及广东省国际科技合作基地发育与再生生物学系	1	1	1.0	1.0